Aus "SEO-Sicht" kann ich Dir das nicht unbedingt beantworten, aus meiner eigenen aber schon.
Wenn Du das über Subdomains machst, kannst Du meiner Meinung nach auch gleich einen Brief an Google schicken "Hallo, ich habe die Subdomains nur um meine Keys zu stärken". Der Einfachheit halber kann man das auch auf seine Startseite schreiben.
Mir gehr es da nicht unbedingt um den Bot und irgendeinen Algo, da habe ich eigentlich keine Bedenken. Mir geht es um den QR als menschlichen Faktor.