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Gleich vorweg: Bin Laie.

Ich sollte einen Backlink im Gegenzug zu einem Eintrag in ein Blogverzeichnis setzen. Vorgabe: Mind. PR3

Gut dachte ich, hab PR4.

Der Verzeichnisbetreiber sagte mir dann aber, dass die Unterseite (also wenn man auf der Startseite den Artikel anklickt und dann nur den Artikel hat), gar nicht ranken würde. Stimmt auch lt. PageRank Checker.

Ich habe daraufhin den Backlink rausgenommen und auf den Eintrag verzichtet.

Später gemerkt, dass das bei anderen auch nicht anders ist.

Ich weiß jetzt nicht, ob ich meinen Blog weiterhin mit PR4 angeben kann oder nicht. Denn nach einer Weile verschwindet der Artikel ja von der Start- in die Unterseiten. Andere haben das bisher nicht moniert. Oder sieht da der Betreiber etwas falsch?

Die Betreiber wollen den Link mit einem gewissen PR der SEITE nicht der Domain.
Deine Unterseiten haben ja auch alle einen PR oder bekommen den irgendwann -- allerdings einen niedrigen.
Du müsstest für solche Blogverzeichnisse den Link quasi in einem bestehenden (PR versehenen) Artikel platzieren und nicht einen neuen Post bauen.
Wobei der themenrelevante Blogpostlink sicherlich wertvoller ist als ein hingeknallter Link in einer themenunrelevanten Unterseite... -- aber das ist ja nicht gefragt...

auf solche verzeichnisse kannst du verzichten.
der soll froh sein dass er überhaupt einen link kriegt.
und würde mich nicht wundern wenn das ausgerechnet die betreiber sind, die dann den katalog plötzlich dichtmachen und für was anderes nutzen oder alle links auf nofollow setzen.