Nun im Ernst:
Zuerst einmal müsste man wissen, von wo du ne -1 bekommen hast, von 3 auf 2, von 10 auf 9 oder von 1 auf 0 z. B.
Ein PR von -1 muss überhaupt keine Bedeutung haben, brauch ja bloß irgendein wichtiger Link weggefallen sein oder verlinkende Seiten wurden abgewertet, was dann ne Kettenreaktion wäre.
Ich würde mir da nicht zu große Gedanken machen. Diese würde ich mir erst dann machen, wenn das Ranking bei wichtigen Keys abfällt.
Im Prinzip kann man auf all Deine drei Hypothesen ein ja oder nein beantworten, und Du bist so schlau wie vorher.