@bydlo:
Die Idee mit dem noindex ist gut. Allerdings verschenkst er so eingehende Deeplinks. Er kann ja beide Lösungen einbauen. Erst ein noindex und wenn alles raus ist per 301 auf die neue(n) Datei(en) umleiten.
@webmix:
Sitemap funktioniert schon. Hängt natürlich davon ab wie "stark" Deine Domain ist und wieviele Seiten Du hast. Aber selbst mir PR3/4 kriegste schon mächtig Zeug in den Index.
Alternative dazu wäre die
Google XML Sitemap. Vorteil ist, dass Google direkt über alle URLs informiert ist und i.d.R. sofort loslegt. Aber bitte nicht übertreiben (d.h. direkt 5000 Seiten oder so anmelden).