Alle Fehler wird dir HTML Tidy auch nicht automatisch beseitigen können. Es wird zwischen Fehlern und Warnungen unterschieden. Die Fehler muss man teilweise selber von Hand beseitigen, die Warnungen kann HTML Tidy beseitigen.
HTML Tidy ist Murks. Es kann passieren, dass das Layout zerstört wird, und zwar dadurch, dass Tidy Whitespace an Stellen einfügt, wo der Entwickler absichtlich keinen Whitespace gemacht hat.