Ich selber verwende auch Joomla und muss sagen, dass es einige ernst zu nehmende "Macken" hat. Vor allem in Richtung Suchmaschinenoptimierung ist bisher fast überhaupt nichts passiert. Zwar gibt es Komponenten, doch taugt bspw. OpenSEF (wurde in der Vergangenheit lange nichts mehr für gemacht) für suchmaschinenfreundliche URLs nicht wirklich (das liegt teilweise aber auch an Joomla selbst). Es gibt zwar noch weitere Komponenten, die besser funktionieren, aber kommerziell vertrieben werden. Jedenfalls muss man bei dem CMS ordentlich im Code rumhacken, um das für SEOs in einen halbwegs ordentlichen Zustand zu bringen. Weiterhin dauert die Entwicklung der neuen 1.5 jetzt schon ne halbe Ewigkeit. Das Rechtemanagement ist noch unzureichend und auch die gesamte itemid-Geschichte ist mehr als ärgerlich. An sich sind wirklich die Vorteile, dass Joomla ne große Community hat und es dutzend, mehr oder weniger brauchbare, Erweiterungen gibt (Komponenten, Module, Mambots). Weiterführend sind folgende Seiten ganz interessant:
mademyday und
"Joomla dissen".
MODx scheint zunehmend interessant zu werden (vor allem in Hinblick auf die Suchmaschinenoptimierung), habs mir aber noch nicht wirklich angeschaut und weiß nicht, wie die Community dahinter ausschaut.