Google indiziert falsche Subdomain?

Hallo liebes Forum,

ich habe ein Problem für das ich eine Lösung suche.
Folgende Ausgangssituation:
Ich betreibe eine Website mit etwa 20 Unterseiten, alle in HTML, alle mit validem Code, entsprechend Suchmaschinenfreundlich.
Traffic auf domain.de wird per 301-Redirect auf www.domain.de weitergeleitet.

Die Domain ansich ist seit über 3 Jahren in meinem Besitz (keine Vorbesitzer). Im Spätsommer letzten Jahres habe ich die neue Version der Seite online gestellt. Trotz Einreichung der sitemap, trotz mehreren guten Links kommt nur die Startseite in den Index. Alle Unterseiten erscheinen nicht. Ich bin inzwischen recht ratlos (habe sogar die IP gewechselt, da ja möglicherweise einige verbrannte Domains auf der selben IP lagen, war ein Shared-Hoster).

Nun habe ich eine Idee:
Und zwar habe ich vor Jahren auf einer Subdomain eine Seite angelegt, welche vor der eigentlichen Seite auf www. bestand. Diese ist hervorragend indiziert. Kann es sein, dass Google subdomain.domain.de als Website ansieht anstatt www.domain.de?

Falls ja, wie kriege ich Google am besten dazu, in Zukunft www.domain.de als "Hauptdomain" anzusehen? 301-Redirect?

Danke für eure Ideen und Erfahrungen,

Viele Grüße
wuschelpuschel

Welchen Inhalt hat die Sub und welchen www?

Die Subdomain beeinhaltet eine kleine Datenbank mit etwa 100 Einträgen. Darin sind Geschäfte mit Adresse, Infos, Öffnungszeiten aufgeführt.

Auf der www-Domain befindet sich die eigentliche Seite, etwa 20 HTML-Seiten, Informationen über eine Firma mit Infos, Wir über uns, Leistungen, etc.

Kann alles sein, von robots.txt über ungewollt gesetzte noindex Tags. URL wäre hilfreich.

Noindex-Tags sind nicht gesetzt, robots.txt:
User-agent: *
Allow: /